姜子牙封神之后，三界迎来了短暂的和平。但随着各方势力的崛起，天庭的统治不再坚不可摧。终于，封神榜被一股邪恶力量击碎，一场不为人知的浩劫正在徐徐展开。封神榜碎片散落在何地？玩家在寻回途中，会遭遇怎样的风景？那些耳熟能详的经典角色剧情，又是否会迎来全新的开始？
哪吒心魔之战
一个布偶，执起它，是哪吒于陈塘关心魔陡起；放下它，是与李靖父子二人冰释前嫌。在传统东方伦理视角中，哪吒割肉还母，剔骨还父的桥段一直是争议不断的部分，以至于封神之后，维系父子二人亲情的纽带也变成了七宝玲珑塔。
《封神再临》的剧情设计，对哪吒父子亲情部分进行了较大改动。在哪吒与敖广、敖丙父子的战斗中，李靖扮演的不再是一个冷血懦弱的父亲形象，而是在经历内心挣扎过后，能够选择和哪吒一起面对，承担一个父亲的责任。在天雷滚滚的刑罚台上，哪吒也将重新认识这位陈塘关总兵。
妲己纣王虐恋
提到妲己，大多数人最先想到的一定是“祸国殃民”四个字，若说帝王江山败颓之势尽数归结于此，未免过于苛责。《封神演义》原著中，纣王因轻辱女娲，才招致祸端，而妲己，不过是助周灭商的一枚棋子。重走封神路，妲己不再是任人摆布，受人利用的单纯狐妖，女娲娘娘的所谓天道，正邪忠奸，不过都是封神榜中早已预留好的位置。魂穿苏家养女，找寻前世记忆，这一次，她要为自己而活。
杨戬天命抗争
“母不以我为子，妹不以我为兄。”虽有通天彻地之能，却无法保护至亲至爱之人，这或许是杨戬一生之痛。自封神榜破碎之后，杨戬奋力御敌身受重伤，法力尽失。从玉虚宫战力天花板到一介凡人，杨戬未免心灰意冷，浑噩度日。仙途低谷之时，又意外得知亲妹妹杨婵于华山身陷危机，而师父玉鼎真人对此却讳莫如深，再加上突然出现的封神榜碎片，似乎有新的奇遇，正在等待杨戬。
除哪吒，杨戬、妲己外，其他角色的故事也会经历重新演绎。这些别出心裁的剧情设计，都会在《封神再临》中以电影化镜头一一展现，重新经历那段战意汹涌、波诡云谲的岁月，所有故事的谜底，都将由玩家一一揭开。